Ejemplos de aplicaciones de esta biotecnología podemos destacar:

-.Uso de plantas y productos marinos para obtener nuevos fármacos y cosméticos. -.Uso de genes de organismos acuáticos para obtener plantas resistentes a las condiciones ambientales. -.Mejora de la efectividad de la vacunación para disminuir la mortalidad de los peces. -.Restauración o preservación de especies acuáticas. -.Control de la proliferación de microorganismos nocivos transmitidos por el agua. -.Búsqueda de nuevas fuentes de energía (biocombustibles) basándose en algas y otros organismos marinos.